НДС и НДФЛ явояются федеральными налогами. Можно ли зачесть переплату по НДС в счет недоимки по НДФЛ? Финансисты в своем письме толком на вопрос не ответили. Как же быть?

НДС и НДФЛ являются федеральными налогами. По общим правилам между налогами одного вида (федеральными, региональными, местными) возможен зачет – статья 78 Налогового кодекса РФ. С этим финансисты и не спорят. Запрета на зачет между НДС и НДФЛ нет. Однако Минфин делает оговорку - уплачивать НДФЛ за счет средств налогового агента нельзя (письмо от 30 августа 2016 г. № 03-07-11/50432). А когда компания гасит НДФЛ за счет НДС, она, по сути. уплачивает налог за счет собственных средств. Да и раньше финансисты были против такого зачета.

Судьи в этом вопросе на сотроне компаний (постанволение ФАС Поволжского округа от 29 октября 2009 г. № А12-7239/2009). Логика такая: как только налоговый агент удержал НДФЛ, задолженность перед бюджетом возникает уже у него. Но если по налогу числится недоимка, значит. налог не удержали. И платить его за счет НДС рискованно.